E-moteオフィシャルです!
大変良いご質問を頂きありがとうございます!
横髪や耳、胸など左右の向きによってはパーツの重ね順に変動が必要なパーツは、
「回り込み調整」という設定項目が存在します。
基礎微左斜めの横髪Lでは、こちらの設定が標準調整されているため、
レイヤーの重ね順が入れ替わるようになっております。
マニュアルの以下の項目を参考に、不要なZ値を調整して不具合を解消して下さい。
http://emote.mtwo.co.jp/emote_ofc_manual3_motion/manual.html#h.3qagont3li4c
使い方によっては、2D絵独特の「嘘」や「騙し絵」を解消する効果がありますので、
色々と調整にチャレンジしてみて下さい!
今後とも有限会社エムツー並びにえもふり・E-moteをどうぞ宜しくお願い申し上げます。